Le FC Cologne a connu sa période la plus glorieuse sur la scène nationale au début des années 1960, remportant deux titres de champion d'Allemagne (1962, 1964) et terminant à trois reprises à la deuxième place (1960, 1963, 1965). 

Depuis 2009, le club dispose également d'une équipe féminine, qui évolue en 2. Bundesliga, la deuxième division allemande de football féminin.

1 Anthony Modeste 2 Yuya Osako  3 Milos Jojic  4 Artjoms Rudnevs  5 Leonardo Bittencourt  6 Simon Zoller 

7 Marcel Risse 8 Christian Clemens    9 Lukas Kluenter    10 Jonas Hector